Фундаментальные исследования.  геномед - анализы и цены Генетическое типирование интерлейкина il 28b

Как показали исследования последних лет, особое влияние на результат лечения, а такжевозможность самостоятельного выздоровления при заражении ,оказывают генетические факторы, особенно полиморфизмы гена интерлейкина 28В.

Интерлейкин 28В является представителем интерферонов-лямбда, илиинтерферонов 3типа, обладающих сильным противовирусным действием и подавляющих репликациювируса гепатита С. Были изучены полиморфизмы гена интерлейкина 28В, связанные сустойчивым вирусологическим ответом. При определенных генотипах достижениеустойчивого вирусологического ответа достигается в 2 раза чаще.Основную роль при инфицировании гепатитом С играют две однонуклеотидные замены:

Замена цитозина на тимин (C>T), имеющая обозначениеrs12979860 в базе данных dbSNPнационального центра биотехнологической информации США (National Center forBiotechnological Information, NCBI).

Замена тимина на гуанин (T>G), имеющая обозначение rs8099917

В зависимости от нуклеотидов в этих локусах, выделены аллели C (цитозин), T (тимин), G(гуанин) и соответствующие генотипы: для аллели rs12979860 – СС, СТ, ТТ, а также ТТ, ТG, GGдля аллелей rs8099917.Получены данные, чтогенотип интерлейкина 28В являетсянезависимым и наиболее достоверным фактором, влияющим на частоту раннего иустойчивого вирусологического ответа наПВТ(противовирусная терапия)среди другихфакторов прогноза.При этом полиморфизмы rs12979860 отвечают за получение ответа, аполиморфизмы rs8099917 тесно связаны с отсутствием ответа на ПВТ.На основании этого рекомендуется следующийалгоритм обследованияприподготовке клечению.

Определение генотипа пациента по IL28B может изменить алгоритм принятия решения олечении путем изменения длительности, как стандартного курса терапии ПЕГ ИФН/РИБ, таки длительности тройной терапии ХГС. Оптимизация терапии позволит избежать многихдополнительных проблем при лечении пациентов с высокой вероятностьюположительного ответа при назначении терапии (избежатьдополнительных побочныхэффектов и дополнительных затрат на тройную терапию, с включениемингибиторовпротеазы – телапревира и боцепревира)

Определение генотипа пациента по IL28B может изменить алгоритм принятия решения олечении путем изменения длительности, как стандартного курса терапии ПЕГ ИФН/РИБ, таки длительности тройной терапии ХГС. Оптимизация терапии позволит избежать многихдополнительных проблем при лечении пациентов с высокой вероятностьюположительного ответа при назначении терапии (избежатьдополнительных побочныхэффектов и дополнительных затрат на тройную терапию, с включениемингибиторов протеазы – телапревира и боцепревира)

Вирусный гепатит С был объявлен европейской ассоциацией по изучению печени излечимым заболеванием. Это означает, что ограниченный по времени курс лечения противовирусными препаратами назначается пациенту один раз. В результате лечения достигается элиминация вируса из крови (устойчивый вирусологический ответ - УВО), нормализация биохимических показателей крови, улучшение состояния печени по данным УЗИ и эластометрии (снижение показателей фиброза вплоть до нормальных значений). Однако, УВО достигается не всегда. Кроме того, среди пациентов, прошедших курс стандартной противовирусной терапии, возможны рецидивы заболевания. В этих случаях назначаются повторные курсы лечения, которые часто приводят к достижению УВО.

Отсутствие адекватного анализа, позволяющего подтвердить выздоровление, а именно удаление вируса не только из крови, но и из печеночных клеток, заставляет гепатологов искать те факторы, которые влияют на прогноз эффективности лечения. К ним относятся факторы вируса - его генотип, и факторы хозяина. Среди этих факторов есть те, на которые нельзя влиять (пол, возраст, длительность заболевания, состояние печени на момент начала лечения), а также факторы, которые можно изменить (например, масса тела и особенности метаболизма).

Как показали исследования последних лет, особое влияние на результат лечения, а также возможность самостоятельного выздоровления при заражении вирусом гепатита С, оказывают генетические факторы, особенно полиморфизмы гена интерлейкина 28В. Интерлейкин 28В является представителем интерферонов-лямбда, или интерферонов 3 типа, обладающих сильным противовирусным действием и подавляющих репликацию вируса гепатита С.

Были изучены полиморфизмы гена интерлейкина 28В, связанные с устойчивым вирусологическим ответом. При определенных генотипах достижение устойчивого вирусологического ответа достигается в 2 раза чаще.

Изучение полиморфизма гена интерлейкина 28В наряду с другими факторами прогноза дает возможность более четко определить прогноз течения инфекции и эффективности лечения. Это важный шаг к индивидуализированной противовирусной терапии, позволяющий определять сроки лечения и дозы препаратов, не только увеличивая их, но и уменьшая.

Метод исследования: ПЦР - амплификация геномной ДНК человека в режиме реального времени.

Полимофизмы:

Как показали исследования последних лет, особое влияние на результат лечения, а такжевозможность самостоятельного выздоровления при заражении ,оказывают генетические факторы, особенно полиморфизмы гена интерлейкина 28В.

Интерлейкин 28В является представителем интерферонов-лямбда, илиинтерферонов 3типа, обладающих сильным противовирусным действием и подавляющих репликациювируса гепатита С. Были изучены полиморфизмы гена интерлейкина 28В, связанные сустойчивым вирусологическим ответом. При определенных генотипах достижениеустойчивого вирусологического ответа достигается в 2 раза чаще.Основную роль при инфицировании гепатитом С играют две однонуклеотидные замены:

Замена цитозина на тимин (C>T), имеющая обозначениеrs12979860 в базе данных dbSNPнационального центра биотехнологической информации США (National Center forBiotechnological Information, NCBI).

Замена тимина на гуанин (T>G), имеющая обозначение rs8099917

В зависимости от нуклеотидов в этих локусах, выделены аллели C (цитозин), T (тимин), G(гуанин) и соответствующие генотипы: для аллели rs12979860 – СС, СТ, ТТ, а также ТТ, ТG, GGдля аллелей rs8099917.Получены данные, чтогенотип интерлейкина 28В являетсянезависимым и наиболее достоверным фактором, влияющим на частоту раннего иустойчивого вирусологического ответа наПВТ(противовирусная терапия)среди другихфакторов прогноза.При этом полиморфизмы rs12979860 отвечают за получение ответа, аполиморфизмы rs8099917 тесно связаны с отсутствием ответа на ПВТ.На основании этого рекомендуется следующийалгоритм обследованияприподготовке клечению.

Определение генотипа пациента по IL28B может изменить алгоритм принятия решения олечении путем изменения длительности, как стандартного курса терапии ПЕГ ИФН/РИБ, таки длительности тройной терапии ХГС. Оптимизация терапии позволит избежать многихдополнительных проблем при лечении пациентов с высокой вероятностьюположительного ответа при назначении терапии (избежатьдополнительных побочныхэффектов и дополнительных затрат на тройную терапию, с включениемингибиторовпротеазы – телапревира и боцепревира)

Определение генотипа пациента по IL28B может изменить алгоритм принятия решения олечении путем изменения длительности, как стандартного курса терапии ПЕГ ИФН/РИБ, таки длительности тройной терапии ХГС. Оптимизация терапии позволит избежать многихдополнительных проблем при лечении пациентов с высокой вероятностьюположительного ответа при назначении терапии (избежатьдополнительных побочныхэффектов и дополнительных затрат на тройную терапию, с включениемингибиторов протеазы – телапревира и боцепревира)

Метод определения Метод сиквенс-специфических праймеров, ПЦР.

Исследуемый материал Цельная кровь (с ЭДТА)

Доступен выезд на дом

ГЕПАТИТ С - инфекционное заболевание, которое у хронически инфицированных пациентов связано с риском развития цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы. Вирус гепатита С (HCV) имеет несколько генотипов, из них наиболее часто в нашей стране встречается вирус гепатита С генотипа 1.

Современная противовирусная терапия хронического гепатита С представляет собой комбинированную терапию пегилированным интерфероном (интерферон с добавленной молекулой полиэтиленгликоля и удлиненным эффектом) и рибавирином (PEG-IFN/RBV, ПЕГ ИФН/РИБ) и позволяет добиться успеха (устойчивого вирусологического ответа) у 40-60% пациентов.

Очевидно, что выявление факторов, влияющих на успех лечения, в том числе генетических, имеет большое значение, как для врача, которому необходимы объективные критерии прогноза эффективности лечения, так и для пациента, который перед началом проведения стандартной терапии должен быть информирован о вероятности ее успеха и побочном действии используемых противовирусных препаратов.

Генетические варианты, связанные с функциями определенных цитокинов, влияют на индивидуальные особенности иммунного ответа на данную инфекцию. IL28B представляет собой интерферон-λ-3 и является лигандом цитокинового рецептора II класса. Эти лиганды запускают JAK/STAT сигнальный каскад, активируя синтез 2’,5’-олигоаденилат-синтетазы, который активирует эндо-нуклеазу. Эндонуклеаза, в свою очередь, участвует в процессах стимуляции образования фермента протеинкиназы, который блокирует синтез вирусных белков.

Показано, что полиморфизмы, ассоциированные с геном IL28B, связаны с вероятностью самопроизвольной элиминации HCV и ответа на противовирусную терапию. Основную роль играют две замены: замена цитозина на тимин (C>T) в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860 и замена тимина на гуанин (T>G) в однонуклеотидном полиморфизме rs8099917.

По однонуклеотидному полиморфизму rs12979860 генотип С/С связан с вдвое более высокой вероятностью положительного ответа на лечение интерфероном и рибавирином, в то время как генотипы T/C и T/T в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение. Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции. Иммунная система носителей аллелей С/С более способна самостоятельно побеждать вирус. Интересно, что при генотипе С/С вирусная нагрузка (количество вируса в крови) до лечения выше, чем у носителей аллелей Т/Т.

По однонуклеотидному полиморфизму rs8099917 генотип Т/Т связан со спонтанным разрешением инфекции, независимо от лечения, в то время как генотипы G/T и G/G в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение и достижения устойчивого вирусологического ответа. Аллель G в rs8099917 является аллелем риска и ассоциирован с низким уровнем ответа на терапию пегилированным интерфероном и рибавирином.

Исследования роли генетического полиморфизма указанных участков человеческого генома показали, что положительное предсказательное значение полиморфизма IL28B выше, чем других базовых характеристик, применяемых для прогноза успеха терапии (индекс массы тела, возраст, стадия фиброза и вирусная нагрузка). Однако, в исследованиях на больших популяциях больных хроническим гепатитом с различным клиническим профилем (стадия фиброза печени от 0 до 4, исходный уровень виремии низкий и высокий) было показано, что предсказательное значение генотипа пациента по IL28 для достижения устойчивого вирусологического ответа может существенно модифицироваться в зависимости от клинических характеристик и снижаться с 74,4% до 37,3% для пациентов с генотипом rs12979860 С/С. Поэтому генетические маркеры необходимо учитывать в комплексе с другими базовыми характеристиками конкретного пациента. Показано, что наибольшее значение полиморфизм IL28B имеет при инфицировании 1 субтипом HCV.

Определение генотипа пациента по IL28B поможет в принятии решения о применении стандартного курса терапии хронического гепатита С ПЕГ ИФН/РИБ и при необходимости индивидуальной оптимизации терапии за счет включения ингибиторов протеазы – телапревира и боцепревира.

Литература

1. Внутренние болезни по Тинсли Р.Харрисону. Практика 2005. 3388 с.

2. Ghary M.G. et al. Diagnosis, management and treatment of hepatitis C: an update. American Association for the Study of Liver Diseases. Hepatology. 2009, Apr; 49 (4): 1335-1374

3. Thomas D.L. et al. Genetic variation in IL28 B and spontaneous clearance of hepatitis C virus. Nature. 2009. Vol. 461, № 7265. P. 798–801.

4. Thompson A.J. et al. Interleukin-28 B polymorphism improves viral kinetics and is the strongest pretreatment predictor of sustained virologic response in genotype 1 hepatitis C virus. Gastroenterology. 2010, Jul; 139 (1): 120–129

5. Материалы производителя реагентов.

ГЕПАТИТ С - инфекционное заболевание, которое у хронически инфицированных пациентов связано с риском развития цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы. Вирус гепатита С (HCV) имеет несколько генотипов, из них наиболее часто в нашей стране встречается вирус гепатита С генотипа 1.

Современная противовирусная терапия хронического гепатита С представляет собой комбинированную терапию пегилированным интерфероном (интерферон с добавленной молекулой полиэтиленгликоля и удлиненным эффектом) и рибавирином (PEG-IFN/RBV, ПЕГ ИФН/РИБ) и позволяет добиться успеха (устойчивого вирусологического ответа) у 40-60% пациентов.

Очевидно, что выявление факторов, влияющих на успех лечения, в том числе генетических, имеет большое значение, как для врача, которому необходимы объективные критерии прогноза эффективности лечения, так и для пациента, который перед началом проведения стандартной терапии должен быть информирован о вероятности ее успеха и побочном действии используемых противовирусных препаратов.

Генетические варианты, связанные с функциями определенных цитокинов, влияют на индивидуальные особенности иммунного ответа на данную инфекцию. IL28B представляет собой интерферон-λ-3 и является лигандом цитокинового рецептора II класса. Эти лиганды запускают JAK/STAT сигнальный каскад, активируя синтез 2’,5’-олигоаденилат-синтетазы, который активирует эндо-нуклеазу. Эндонуклеаза, в свою очередь, участвует в процессах стимуляции образования фермента протеинкиназы, который блокирует синтез вирусных белков.

Показано, что полиморфизмы, ассоциированные с геном IL28B, связаны с вероятностью самопроизвольной элиминации HCV и ответа на противовирусную терапию. Основную роль играют две замены: замена цитозина на тимин (C>T) в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860 и замена тимина на гуанин (T>G) в однонуклеотидном полиморфизме rs8099917.

По однонуклеотидному полиморфизму rs12979860 генотип С/С связан с вдвое более высокой вероятностью положительного ответа на лечение интерфероном и рибавирином, в то время как генотипы T/C и T/T в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение. Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции. Иммунная система носителей аллелей С/С более способна самостоятельно побеждать вирус. Интересно, что при генотипе С/С вирусная нагрузка (количество вируса в крови) до лечения выше, чем у носителей аллелей Т/Т.

По однонуклеотидному полиморфизму rs8099917 генотип Т/Т связан со спонтанным разрешением инфекции, независимо от лечения, в то время как генотипы G/T и G/G в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение и достижения устойчивого вирусологического ответа. Аллель G в rs8099917 является аллелем риска и ассоциирован с низким уровнем ответа на терапию пегилированным интерфероном и рибавирином.

Исследования роли генетического полиморфизма указанных участков человеческого генома показали, что положительное предсказательное значение полиморфизма IL28B выше, чем других базовых характеристик, применяемых для прогноза успеха терапии (индекс массы тела, возраст, стадия фиброза и вирусная нагрузка). Однако, в исследованиях на больших популяциях больных хроническим гепатитом с различным клиническим профилем (стадия фиброза печени от 0 до 4, исходный уровень виремии низкий и высокий) было показано, что предсказательное значение генотипа пациента по IL28 для достижения устойчивого вирусологического ответа может существенно модифицироваться в зависимости от клинических характеристик и снижаться с 74,4% до 37,3% для пациентов с генотипом rs12979860 С/С. Поэтому генетические маркеры необходимо учитывать в комплексе с другими базовыми характеристиками конкретного пациента. Показано, что наибольшее значение полиморфизм IL28B имеет при инфицировании 1 субтипом HCV.

Специальной подготовки не требуется.

  1. Прогнозирование исхода заболевания и ответа на лечение.
  2. Выбор между стандартным и пегилированным интерфероном в комбинации с рибавирином для лечения хронического гепатита С.
  3. Выбор тактики «ожидание доступности тройной терапии с включением ингибиторов протеазы HCV» или лечение стандартной схемой двойной терапии интерфероном в комбинации с рибавирином для пациентов c дополнительными факторами (кроме фиброза печени), уменьшающими вероятность излечения препаратами существующего стандарта противовирусной терапии.

Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Интерпретация результатов


ПОЛИМОРФИЗМ:

ГЕН, ЗАМЕНА В ДНК,

ОБОЗНАЧЕНИЕ В NCBI

ГЕНОТИП ВАРИАНТЫ ЗАКЛЮЧЕНИЙ
С/С Полиморфизм в гене IL28B: rs12979860 не выявлен. Возможно спонтанное разрешение инфекции. Около 80% пациентов с ХГС отвечают на лечение. Характерна высокая вирусная нагрузка.
С/Т Выявлен полиморфизм в гене IL28B: rs12979860 в гетерозиготной форме. 20-40% пациентов с ХГС отвечают на лечение
Т/Т Выявлен полиморфизм в гене IL28B: rs12979860 в гомозиготной форме. 20-25% пациентов с ХГС отвечают на лечение.
Т/Т Полиморфизм в гене IL28B: rs809991 не выявлен. Возможно спонтанное разрешение инфекции. Около 70% пациентов с ХГС отвечают на лечение.
G/T Выявлен полиморфизм в гене IL28B: rs8099917 в гетерозиготной форме. Сниженный ответ на терапию интерфероном и рибавирином
G/G Выявлен полиморфизм в гене IL28B: rs8099917 в гомозиготной форме. Низкий ответ на терапию интерфероном и рибавирином.

1. Внутренние болезни по Тинсли Р.Харрисону. Практика 2005. 3388 с.

2. Ghary M.G. et al. Diagnosis, management and treatment of hepatitis C: an update. American Association for the Study of Liver Diseases. Hepatology. 2009, Apr; 49 (4): 1335-1374

3. Thomas D.L. et al. Genetic variation in IL28 B and spontaneous clearance of hepatitis C virus. Nature. 2009. Vol. 461, № 7265. P. 798–801.

4. Thompson A.J. et al. Interleukin-28 B polymorphism improves viral kinetics and is the strongest pretreatment predictor of sustained virologic response in genotype 1 hepatitis C virus. Gastroenterology. 2010, Jul; 139 (1): 120–129

5. Материалы производителя реагентов.