Temeljne raziskave.  genomed - analize in cene Genetska tipizacija interlevkina il 28b

Kot so pokazale študije zadnjih let, imajo genetski dejavniki, predvsem polimorfizmi gena za interlevkin 28B, poseben vpliv na rezultat zdravljenja, pa tudi možnost samoozdravitve v primeru okužbe.

Interlevkin 28B je predstavnik lambda interferonov ali interferonov tipa 3, ki imajo močan protivirusni učinek in zavirajo razmnoževanje virusa hepatitisa C. Preučevali so polimorfizme gena za interlevkin 28B, povezane s trajnim virološkim odzivom. Pri nekaterih genotipih je trajen virološki odziv dosežen 2-krat pogosteje. Glavno vlogo pri okužbi s hepatitisom C imata dve posamični nukleotidni substituciji:

Substitucija citozina na timin (C>T), označena kot rs12979860 v bazi podatkov dbSNP Nacionalnega centra za biotehnološke informacije (NCBI).

Zamenjava timina za gvanin (T>G), ki ima oznako rs8099917

Glede na nukleotide v teh lokusih so bili identificirani aleli C (citozin), T (timin), G (gvanin) in ustrezni genotipi: za alel rs12979860 - CC, CT, TT, pa tudi TT, TG, GG za aleli rs8099917. da je genotip interlevkina 28B neodvisen in najpomembnejši dejavnik, ki vpliva na pogostost zgodnjega in trajnega virološkega odziva na AVT (protivirusno zdravljenje) med drugimi prognostičnimi dejavniki. Hkrati pa so polimorfizmi rs12979860 odgovorni za pridobitev odziva, in rs8099917 apolimorfizmi so tesno povezani z pomanjkanjem odziva na AVT.Na podlagi tega je naslednji algoritem priporočljiv za preglede v pripravah na zdravljenje.

Določitev pacientovega genotipa z IL28B lahko spremeni algoritem odločanja o zdravljenju s spremembo trajanja tako standardnega poteka terapije PEG IFN/RIB kot trajanja trojne terapije za CHC. Optimizacija terapije se bo izognila številnim dodatnim težavam pri zdravljenju bolnikov z veliko verjetnostjo pozitivnega odziva na terapijo (da bi se izognili dodatnim stranskim učinkom in dodatnim stroškom za trojno terapijo, vključno z zaviralci proteaz - telaprevir in boceprevir)

Določitev pacientovega genotipa z IL28B lahko spremeni algoritem odločanja o zdravljenju s spremembo trajanja tako standardnega poteka terapije PEG IFN/RIB kot trajanja trojne terapije za CHC. Optimizacija terapije se bo izognila številnim dodatnim težavam pri zdravljenju bolnikov z veliko verjetnostjo pozitivnega odziva na terapijo (da bi se izognili dodatnim stranskim učinkom in dodatnim stroškom za trojno terapijo, vključno z zaviralci proteaz - telaprevir in boceprevir)

Evropsko združenje za preučevanje jeter je virusni hepatitis C razglasilo za ozdravljivo bolezen. To pomeni, da se bolniku enkrat dodeli časovno omejen tečaj protivirusnega zdravljenja. Kot rezultat zdravljenja se doseže eliminacija virusa iz krvi (trajni virološki odziv - SVR), normalizacija biokemičnih parametrov krvi, izboljšanje jeter po ultrazvoku in elastometriji (zmanjšanje kazalnikov fibroze na normalne vrednosti). Vendar pa SVR ni vedno dosežen. Poleg tega so pri bolnikih, ki so zaključili tečaj standardne protivirusne terapije, možni recidivi bolezni. V teh primerih so predpisani ponavljajoči se tečaji zdravljenja, ki pogosto vodijo do doseganja SVR.

Pomanjkanje ustrezne analize za potrditev okrevanja, in sicer odstranitev virusa ne le iz krvi, ampak tudi iz jetrnih celic, prisili hepatologe, da iščejo tiste dejavnike, ki vplivajo na napoved učinkovitosti zdravljenja. Ti vključujejo dejavnike virusa - njegov genotip in dejavnike gostitelja. Med temi dejavniki so tisti, na katere ni mogoče vplivati ​​(spol, starost, trajanje bolezni, stanje jeter v času zdravljenja), pa tudi dejavniki, ki jih je mogoče spremeniti (na primer telesna teža in presnovne značilnosti).

Kot so pokazale študije zadnjih let, imajo genetski dejavniki, predvsem polimorfizmi gena za interlevkin 28B, poseben učinek na rezultat zdravljenja, pa tudi možnost samoozdravitve ob okužbi z virusom hepatitisa C. Interlevkin 28B je predstavnik lambda interferonov ali interferonov tipa 3, ki imajo močan protivirusni učinek in zavirajo razmnoževanje virusa hepatitisa C.

Proučevali so polimorfizme gena za interlevkin 28B, povezane s trajnim virološkim odzivom. Pri določenih genotipih je 2-krat pogosteje dosežen trajni virološki odziv.

Študija polimorfizma gena za interlevkin 28B skupaj z drugimi prognostičnimi dejavniki omogoča jasnejšo določitev prognoze poteka okužbe in učinkovitosti zdravljenja. To je pomemben korak k individualizirani protivirusni terapiji, ki vam omogoča, da določite trajanje zdravljenja in odmerke zdravil, ne samo da jih povečate, temveč tudi zmanjšate.

Raziskovalna metoda: PCR - amplifikacija človeške genomske DNK v realnem času.

polimofizmi:

Kot so pokazale študije zadnjih let, imajo genetski dejavniki, predvsem polimorfizmi gena za interlevkin 28B, poseben vpliv na rezultat zdravljenja, pa tudi možnost samoozdravitve v primeru okužbe.

Interlevkin 28B je predstavnik lambda interferonov ali interferonov tipa 3, ki imajo močan protivirusni učinek in zavirajo razmnoževanje virusa hepatitisa C. Preučevali so polimorfizme gena za interlevkin 28B, povezane s trajnim virološkim odzivom. Pri nekaterih genotipih je trajen virološki odziv dosežen 2-krat pogosteje. Glavno vlogo pri okužbi s hepatitisom C imata dve posamični nukleotidni substituciji:

Substitucija citozina na timin (C>T), označena kot rs12979860 v bazi podatkov dbSNP Nacionalnega centra za biotehnološke informacije (NCBI).

Zamenjava timina za gvanin (T>G), ki ima oznako rs8099917

Glede na nukleotide v teh lokusih so bili identificirani aleli C (citozin), T (timin), G (gvanin) in ustrezni genotipi: za alel rs12979860 - CC, CT, TT, pa tudi TT, TG, GG za aleli rs8099917. da je genotip interlevkina 28B neodvisen in najpomembnejši dejavnik, ki vpliva na pogostost zgodnjega in trajnega virološkega odziva na AVT (protivirusno zdravljenje) med drugimi prognostičnimi dejavniki. Hkrati pa so polimorfizmi rs12979860 odgovorni za pridobitev odziva, in rs8099917 apolimorfizmi so tesno povezani z pomanjkanjem odziva na AVT.Na podlagi tega je naslednji algoritem priporočljiv za preglede v pripravah na zdravljenje.

Določitev pacientovega genotipa z IL28B lahko spremeni algoritem odločanja o zdravljenju s spremembo trajanja tako standardnega poteka terapije PEG IFN/RIB kot trajanja trojne terapije za CHC. Optimizacija terapije se bo izognila številnim dodatnim težavam pri zdravljenju bolnikov z veliko verjetnostjo pozitivnega odziva na terapijo (da bi se izognili dodatnim stranskim učinkom in dodatnim stroškom za trojno terapijo, vključno z zaviralci proteaz - telaprevir in boceprevir)

Določitev pacientovega genotipa z IL28B lahko spremeni algoritem odločanja o zdravljenju s spremembo trajanja tako standardnega poteka terapije PEG IFN/RIB kot trajanja trojne terapije za CHC. Optimizacija terapije se bo izognila številnim dodatnim težavam pri zdravljenju bolnikov z veliko verjetnostjo pozitivnega odziva na terapijo (da bi se izognili dodatnim stranskim učinkom in dodatnim stroškom za trojno terapijo, vključno z zaviralci proteaz - telaprevir in boceprevir)

Metoda določanja Metoda zaporedno specifičnih primerjev, PCR.

Material v študiji Polna kri (z EDTA)

Možnost obiska na domu

HEPATITIS C je nalezljiva bolezen, ki je pri kronično okuženih bolnikih povezana s tveganjem za razvoj ciroze jeter in hepatocelularnega karcinoma. Virus hepatitisa C (HCV) ima več genotipov, od katerih je pri nas najpogostejši virus hepatitisa C genotip 1.

Sodobno protivirusno zdravljenje kroničnega hepatitisa C je kombinirano zdravljenje s pegiliranim interferonom (interferon z dodano molekulo polietilen glikola in podaljšanim učinkom) in ribavirinom (PEG-IFN/RBV, PEG IFN/RIB) in omogoča doseganje uspeha (trajen virološki odziv). ) pri 40-60 % bolnikov.

Očitno je identifikacija dejavnikov, ki vplivajo na uspešnost zdravljenja, tudi genetskih, velikega pomena, tako za zdravnika, ki potrebuje objektivna merila za napovedovanje učinkovitosti zdravljenja, kot za bolnika, ki ga je treba pred začetkom standardne terapije obveščeni o verjetnosti njegovega uspeha in stranskih učinkih uporabljenih protivirusnih zdravil.

Genetske variante, povezane s funkcijami določenih citokinov, vplivajo na posamezne značilnosti imunskega odziva na dano okužbo. IL28B je interferon-λ-3 in je ligand citokinskega receptorja razreda II. Ti ligandi sprožijo signalno kaskado JAK/STAT, ki aktivirajo sintezo 2',5'-oligoadenilat sintetaze, ki aktivira endonukleazo. Endonukleaza pa je vključena v procese spodbujanja tvorbe encima protein kinaze, ki blokira sintezo virusnih beljakovin.

Pokazalo se je, da so polimorfizmi, povezani z genom IL28B, povezani z verjetnostjo spontane eliminacije HCV in odzivom na protivirusno terapijo. Dve substituciji igrata glavno vlogo: substitucija citozina na timin (C>T) pri polimorfizmu enega nukleotida rs12979860 in substitucija timina na gvanin (T>G) pri polimorfizmu enega nukleotida rs8099917.

Za polimorfizem enega nukleotida rs12979860 je genotip C/C povezan z dvakratno verjetnostjo pozitivnega odziva na zdravljenje z interferonom in ribavirinom, medtem ko sta genotipa T/C in T/T na tem položaju povezana z manjšo verjetnostjo odziva. na zdravljenje. Genotip CC se pretežno odkrije pri ljudeh s spontano razrešitvijo okužbe. Imunski sistem nosilcev alela C/C je bolj sposoben sam premagati virus. Zanimivo je, da je pri genotipu C/C virusna obremenitev (količina virusa v krvi) pred zdravljenjem višja kot pri nosilcih alelov T/T.

Glede na polimorfizem enega nukleotida rs8099917 je genotip T/T povezan s spontano razrešitvijo okužbe, ne glede na zdravljenje, medtem ko sta genotipa G/T in G/G na tem položaju povezana z manjšo verjetnostjo odziva na zdravljenje in doseganje trajnega virološkega odziva. Alel G v rs8099917 je alel tveganja in je povezan s slabim odzivom na zdravljenje s pegiliranim interferonom in ribavirinom.

Študije o vlogi genetskega polimorfizma v teh predelih človeškega genoma so pokazale, da je pozitivna napovedna vrednost polimorfizma IL28B višja od drugih osnovnih značilnosti, ki se uporabljajo za napovedovanje uspeha terapije (indeks telesne mase, starost, stopnja fibroze in virusna obremenitev). . Vendar pa se je v študijah na velikih populacijah bolnikov s kroničnim hepatitisom z različnimi kliničnimi profili (faza jetrne fibroze od 0 do 4, začetna stopnja viremije nizka in visoka) pokazalo, da je napovedna vrednost bolnikovega genotipa IL28 za doseganje trajnega virološkega odziva se lahko bistveno spremeni glede na klinične značilnosti in zmanjša s 74,4 % na 37,3 % pri bolnikih z genotipom rs12979860 C/C. Zato je treba genetske markerje upoštevati v kombinaciji z drugimi osnovnimi značilnostmi posameznega bolnika. Dokazano je, da ima polimorfizem IL28B največjo vrednost, ko je okužen s HCV podtipa 1.

Določitev bolnikovega genotipa z IL28B bo pomagala pri odločitvi o uporabi standardnega poteka terapije kroničnega hepatitisa C s PEG IFN/RIB in po potrebi individualni optimizaciji terapije z vključitvijo zaviralcev proteaz - telaprevirja in boceprevirja.

Literatura

1. Notranje bolezni po Tinsley R. Harrison. Praksa 2005. 3388 str.

2. Ghary M.G. et al. Diagnoza, zdravljenje in zdravljenje hepatitisa C: posodobitev. Ameriško združenje za preučevanje jetrnih bolezni. hepatologija. 2009, april; 49 (4): 1335-1374

3. Thomas D.L. et al. Genetska variacija IL28 B in spontani očistek virusa hepatitisa C. Narava. 2009 letnik 461, št. 7265. P. 798–801.

4. Thompson A.J. et al. Polimorfizem interlevkina-28 B izboljša virusno kinetiko in je najmočnejši napovedovalec trajnega virološkega odziva pri virusu hepatitisa C genotipa 1 pred zdravljenjem. gastroenterologija. julij 2010; 139 (1): 120–129

5. Materiali proizvajalca reagenta.

HEPATITIS C- nalezljiva bolezen, ki je pri kronično okuženih bolnikih povezana s tveganjem za nastanek ciroze jeter in hepatocelularnega karcinoma. Virus hepatitisa C (HCV) ima več genotipov, od katerih je pri nas najpogostejši virus hepatitisa C genotip 1.

Sodobno protivirusno zdravljenje kroničnega hepatitisa C je kombinirano zdravljenje s pegiliranim interferonom (interferon z dodano molekulo polietilen glikola in podaljšanim učinkom) in ribavirinom (PEG-IFN/RBV, PEG IFN/RIB) in omogoča doseganje uspeha (trajen virološki odziv). ) pri 40-60 % bolnikov.

Očitno je identifikacija dejavnikov, ki vplivajo na uspešnost zdravljenja, tudi genetskih, velikega pomena, tako za zdravnika, ki potrebuje objektivna merila za napovedovanje učinkovitosti zdravljenja, kot za bolnika, ki ga je treba pred začetkom standardne terapije obveščeni o verjetnosti njegovega uspeha in stranskih učinkih uporabljenih protivirusnih zdravil.

Genetske variante, povezane s funkcijami določenih citokinov, vplivajo na posamezne značilnosti imunskega odziva na dano okužbo. IL28B je interferon-λ-3 in je ligand citokinskega receptorja razreda II. Ti ligandi sprožijo signalno kaskado JAK/STAT, ki aktivirajo sintezo 2',5'-oligoadenilat sintetaze, ki aktivira endonukleazo. Endonukleaza pa je vključena v procese spodbujanja tvorbe encima protein kinaze, ki blokira sintezo virusnih beljakovin.

Pokazalo se je, da so polimorfizmi, povezani z genom IL28B, povezani z verjetnostjo spontane eliminacije HCV in odzivom na protivirusno terapijo. Dve substituciji igrata glavno vlogo: substitucija citozina na timin (C>T) pri polimorfizmu enega nukleotida rs12979860 in substitucija timina na gvanin (T>G) pri polimorfizmu enega nukleotida rs8099917.

Za polimorfizem enega nukleotida rs12979860 je genotip C/C povezan z dvakratno verjetnostjo pozitivnega odziva na zdravljenje z interferonom in ribavirinom, medtem ko sta genotipa T/C in T/T na tem položaju povezana z manjšo verjetnostjo odziva. na zdravljenje. Genotip CC se pretežno odkrije pri ljudeh s spontano razrešitvijo okužbe. Imunski sistem nosilcev alela C/C je bolj sposoben sam premagati virus. Zanimivo je, da je pri genotipu C/C virusna obremenitev (količina virusa v krvi) pred zdravljenjem višja kot pri nosilcih alelov T/T.

Glede na polimorfizem enega nukleotida rs8099917 je genotip T/T povezan s spontano razrešitvijo okužbe, ne glede na zdravljenje, medtem ko sta genotipa G/T in G/G na tem položaju povezana z manjšo verjetnostjo odziva na zdravljenje in doseganje trajnega virološkega odziva. Alel G v rs8099917 je alel tveganja in je povezan s slabim odzivom na zdravljenje s pegiliranim interferonom in ribavirinom.

Študije o vlogi genetskega polimorfizma v teh predelih človeškega genoma so pokazale, da je pozitivna napovedna vrednost polimorfizma IL28B višja od drugih osnovnih značilnosti, ki se uporabljajo za napovedovanje uspeha terapije (indeks telesne mase, starost, stopnja fibroze in virusna obremenitev). . Vendar pa se je v študijah na velikih populacijah bolnikov s kroničnim hepatitisom z različnimi kliničnimi profili (faza jetrne fibroze od 0 do 4, začetna stopnja viremije nizka in visoka) pokazalo, da je napovedna vrednost bolnikovega genotipa IL28 za doseganje trajnega virološkega odziva se lahko bistveno spremeni glede na klinične značilnosti in zmanjša s 74,4 % na 37,3 % pri bolnikih z genotipom rs12979860 C/C. Zato je treba genetske markerje upoštevati v kombinaciji z drugimi osnovnimi značilnostmi posameznega bolnika. Dokazano je, da ima polimorfizem IL28B največjo vrednost, ko je okužen s HCV podtipa 1.

Posebno usposabljanje ni potrebno.

  1. Napovedovanje izida bolezni in odziva na zdravljenje.
  2. Izbira med standardnim in pegiliranim interferonom v kombinaciji z ribavirinom za zdravljenje kroničnega hepatitisa C.
  3. Izbira taktike »čakanje na razpoložljivost trojne terapije z vključitvijo zaviralcev proteaze HCV« ali zdravljenja s standardnim režimom dvojne terapije z interferonom v kombinaciji z ribavirinom za bolnike z dodatnimi dejavniki (razen fibroze jeter), ki zmanjšujejo verjetnost zdravljenja z zdravili obstoječega standarda protivirusne terapije.

Interpretacija rezultatov preiskav vsebuje informacije za lečečega zdravnika in ni diagnoza. Podatki v tem razdelku se ne smejo uporabljati za samodiagnozo ali samozdravljenje. Natančno diagnozo postavi zdravnik z uporabo rezultatov tega pregleda in potrebnih informacij iz drugih virov: anamneze, rezultatov drugih preiskav itd.

Interpretacija rezultatov


POLIMORFIZEM:

GEN, ZAMENJAVA V DNK,

IMENOVANJE V NCBI

GENOTIPAMOŽNOSTI ZAKLJUČKI
S/SPolimorfizma v genu IL28B: rs12979860 niso zaznali. Možna je spontana razrešitev okužbe. Približno 80 % bolnikov s HCV se odzove na zdravljenje. Ima visoko virusno obremenitev.
S/TUgotovljen je bil polimorfizem v genu IL28B: rs12979860 v heterozigotni obliki. 20-40 % bolnikov s KHC se odzove na zdravljenje
T/TUgotovljen je bil polimorfizem v genu IL28B: rs12979860 v homozigotni obliki. 20-25 % bolnikov s CHC se odzove na zdravljenje.
T/TPolimorfizma v genu IL28B: rs809991 niso zaznali. Možna je spontana razrešitev okužbe. Približno 70 % bolnikov s HCV se odzove na zdravljenje.
G/TUgotovljen je bil polimorfizem v genu IL28B: rs8099917 v heterozigotni obliki. Zmanjšan odziv na zdravljenje z interferonom in ribavirinom
G/GUgotovljen je bil polimorfizem v genu IL28B: rs8099917 v homozigotni obliki. Slab odziv na zdravljenje z interferonom in ribavirinom.

1. Notranje bolezni po Tinsley R. Harrison. Praksa 2005. 3388 str.

2. Ghary M.G. et al. Diagnoza, zdravljenje in zdravljenje hepatitisa C: posodobitev. Ameriško združenje za preučevanje jetrnih bolezni. hepatologija. 2009, april; 49 (4): 1335-1374

3. Thomas D.L. et al. Genetska variacija IL28 B in spontani očistek virusa hepatitisa C. Narava. 2009 letnik 461, št. 7265. P. 798–801.

4. Thompson A.J. et al. Polimorfizem interlevkina-28 B izboljša virusno kinetiko in je najmočnejši napovedovalec trajnega virološkega odziva pri virusu hepatitisa C genotipa 1 pred zdravljenjem. gastroenterologija. julij 2010; 139 (1): 120–129

5. Materiali proizvajalca reagenta.